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Pfu DNA 连接酶是一种源自强烈炽热球菌超嗜热海洋古细菌的重组酶。重组 DNA 连接酶具有比 Tth DNA 连接酶更高的连接特异性和更低的背景。Pfu DNA 连接酶能够在 45 °C 至 80 °C 下催化双链 DNA 相邻 5’-磷酸基和 3’-羟基末端的连接,缺口封闭反应的最佳温度接近 70 °C。连接酶具有高度热稳定性,且具有较高的熔化温度,可提高连接酶链反应 (LCR) 的可靠性。
T4 DNA 连接酶形成磷酸二酯键,以催化双链 DNA 中相邻的 5’-磷酸基和 3’-羟基末端连接。这种酶用于在过夜反应中连接黏性末端。这种酶可高效连接平末端和黏性末端,并修复双螺旋 DNA、RNA 或 DNA/RNA 杂交体中的单链切口。