赛默飞色谱与质谱分析
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当前位置: 赛默飞 应用文献 人工智能搜索引擎 CHIMERYS 助力快速、深度蛋白组覆盖

人工智能搜索引擎 CHIMERYS 助力快速、深度蛋白组覆盖

2023-06-29
  • 多组学/蛋白质组/代谢组/脂质组
  • 酶解肽段标准品
  • CHIMERYS 蛋白鉴定
摘要

全新的智能搜索引擎CHIMERYS?,是赛默飞与蛋白质组学人工

智能领域的领导者MSAID?的合作成果,是全新一代为解析混合

谱而生的人工智能算法。这种革命性的算法可以大大提升DDA

数据中被识别的PSM数量,从而实现鉴定数目性能上的巨大飞

跃。CHIMERYS 基于 INFERYS 算法[1]构建,其中 INFERYS 使用深

度学习模型预测肽段的 MS/MS 谱图,CHIMERYS 进一步尝试解

释 MS/MS 谱图中的每一个峰。因此,可以有效进行混合谱图的解

析。

CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段和蛋白的鉴

定、非标记定量(LFQ)、TMT标记定量,不仅可改善鉴定蛋白

质的数量,还可提高定量性能。本文使用 Hela 标准肽段,在不同

分析梯度和样品通量,包括8min到60min的5个不同梯度分别进行

DDA数据采集,对比 SequestHT 和 CHIMERYS 搜库结果,在不同

梯度下,CHIMERYS

均有不同程度的提升,其中梯度越短,谱图

越复杂,提升比例越高,表明 CHIMERYS 适合复杂谱图的解析。

在使用 CHIMERYS 后,180SPD通量可获得原来 60SPD 使用 Se-

questHT时一致的蛋白和肽段鉴定,提示我们在后续使用CHIME-

RYS进行数据解析可有效提高样品分析通量。另外,本文中也对

CHIMERYS搜索结果的可信程度进行了讨论。


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